温州大学苍南研究院是一所独立法人研究机构。研究院于2016年12月由温州大学与浙江省苍南县人民政府共建，2017年9月正式挂牌成立。研究院位于苍南县灵溪镇海西电商城二楼，总面积约1200平方米。交通非常方便，距离苍南动车站仅500米，距离高速出口仅3公里，温州大学到研究院不到40分钟的高速车程，动车车程为15分钟。
研究院依托温州大学的人才和科研力量，引进和汇聚一批高层次专家与人才，在智能制造、机械仪表、新材料产业技术、包装印刷、防伪商标、生物制药与食品、大数据信息技术支持与处理、建筑工程与防灾减灾、水环境处理与保护、文化创意、非物质文化遗产等领域协同苍南县政府和企业开展决策咨询、技术攻关，承担苍南县相关企业的技术难题攻关，协助苍南县相关企业进行产业改造、升级和优化，促进产业结构调整，推动地方经济的可持续发展。同时开展各类产业技术培训、专题讲座、短期进修和委托培养等人力资源培训工作。
苍南研究院实行理事会领导下的院长负责制，实行以“团队+项目”的运行模式。目前，研究院有智能仪表技术团队、塑料制品精密加工设备技术团队、塑料制品新材料及技术团队、食品加工新技术团队、城市水污染治理团队、印刷行业智能化技术团队、金融设备智能化技术团队、滨海软地基工程和防灾减灾技术团队等8支团队入驻。每支团队由温州大学一位资深教授牵头负责、3-5位具有博士学位的技术骨干和若干位企业行业专家组成。每个中心以高水平平台、团队建设为目标，以重点研发项目为核心工作任务，广泛开展产学研合作，促进成果转移与转化。